Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX93

PALLD, Palladin, humanhuman

Predictions only

Length 1,383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALLDQ8WX93 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PALLDQ8WX93 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PALLDQ8WX93 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PALLDQ8WX93 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PALLDQ8WX93 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PALLDQ8WX93 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PALLDQ8WX93 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PALLDQ8WX93 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PALLDQ8WX93 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PALLDQ8WX93 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PALLDQ8WX93 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PALLDQ8WX93 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PALLDQ8WX93 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PALLDQ8WX93 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PALLDQ8WX93 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PALLDQ8WX93 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PALLDQ8WX93 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PALLDQ8WX93 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PALLDQ8WX93 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PALLDQ8WX93 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PALLDQ8WX93 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PALLDQ8WX93 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PALLDQ8WX93 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PALLDQ8WX93 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PALLDQ8WX93 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PALLDQ8WX93 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PALLDQ8WX93 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PALLDQ8WX93 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PALLDQ8WX93 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PALLDQ8WX93 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PALLDQ8WX93 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PALLDQ8WX93 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PALLDQ8WX93 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PALLDQ8WX93 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PALLDQ8WX93 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PALLDQ8WX93 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PALLDQ8WX93 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PALLDQ8WX93 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PALLDQ8WX93 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PALLDQ8WX93 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PALLDQ8WX93 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PALLDQ8WX93 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PALLDQ8WX93 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PALLDQ8WX93 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PALLDQ8WX93 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PALLDQ8WX93 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PALLDQ8WX93 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PALLDQ8WX93 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PALLDQ8WX93 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PALLDQ8WX93 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PALLDQ8WX93 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PALLDQ8WX93 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PALLDQ8WX93 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PALLDQ8WX93 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PALLDQ8WX93 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PALLDQ8WX93 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PALLDQ8WX93 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PALLDQ8WX93 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PALLDQ8WX93 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PALLDQ8WX93 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PALLDQ8WX93 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PALLDQ8WX93 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PALLDQ8WX93 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PALLDQ8WX93 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PALLDQ8WX93 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PALLDQ8WX93 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PALLDQ8WX93 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PALLDQ8WX93 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PALLDQ8WX93 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PALLDQ8WX93 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PALLDQ8WX93 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PALLDQ8WX93 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PALLDQ8WX93 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PALLDQ8WX93 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PALLDQ8WX93 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PALLDQ8WX93 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PALLDQ8WX93 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PALLDQ8WX93 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PALLDQ8WX93 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PALLDQ8WX93 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PALLDQ8WX93 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PALLDQ8WX93 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PALLDQ8WX93 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PALLDQ8WX93 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PALLDQ8WX93 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PALLDQ8WX93 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PALLDQ8WX93 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PALLDQ8WX93 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PALLDQ8WX93 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PALLDQ8WX93 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PALLDQ8WX93 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PALLDQ8WX93 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PALLDQ8WX93 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PALLDQ8WX93 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PALLDQ8WX93 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PALLDQ8WX93 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PALLDQ8WX93 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PALLDQ8WX93 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PALLDQ8WX93 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PALLDQ8WX93 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms