Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWL2

SPIRE2, Protein spire homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE2Q8WWL2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SPIRE2Q8WWL2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPIRE2Q8WWL2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPIRE2Q8WWL2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPIRE2Q8WWL2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPIRE2Q8WWL2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPIRE2Q8WWL2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPIRE2Q8WWL2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPIRE2Q8WWL2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPIRE2Q8WWL2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPIRE2Q8WWL2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPIRE2Q8WWL2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPIRE2Q8WWL2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPIRE2Q8WWL2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms