Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW33

GTSF1, Gametocyte-specific factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTSF1Q8WW33 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTSF1Q8WW33 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTSF1Q8WW33 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTSF1Q8WW33 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTSF1Q8WW33 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTSF1Q8WW33 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTSF1Q8WW33 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTSF1Q8WW33 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTSF1Q8WW33 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTSF1Q8WW33 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTSF1Q8WW33 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTSF1Q8WW33 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTSF1Q8WW33 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTSF1Q8WW33 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTSF1Q8WW33 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTSF1Q8WW33 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTSF1Q8WW33 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTSF1Q8WW33 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GTSF1Q8WW33 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTSF1Q8WW33 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTSF1Q8WW33 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTSF1Q8WW33 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTSF1Q8WW33 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTSF1Q8WW33 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTSF1Q8WW33 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTSF1Q8WW33 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTSF1Q8WW33 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTSF1Q8WW33 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTSF1Q8WW33 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTSF1Q8WW33 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTSF1Q8WW33 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GTSF1Q8WW33 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTSF1Q8WW33 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTSF1Q8WW33 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTSF1Q8WW33 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTSF1Q8WW33 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTSF1Q8WW33 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTSF1Q8WW33 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GTSF1Q8WW33 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTSF1Q8WW33 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTSF1Q8WW33 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTSF1Q8WW33 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GTSF1Q8WW33 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTSF1Q8WW33 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTSF1Q8WW33 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTSF1Q8WW33 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTSF1Q8WW33 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTSF1Q8WW33 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTSF1Q8WW33 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTSF1Q8WW33 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTSF1Q8WW33 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTSF1Q8WW33 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTSF1Q8WW33 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTSF1Q8WW33 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTSF1Q8WW33 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GTSF1Q8WW33 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTSF1Q8WW33 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTSF1Q8WW33 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTSF1Q8WW33 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTSF1Q8WW33 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTSF1Q8WW33 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTSF1Q8WW33 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTSF1Q8WW33 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTSF1Q8WW33 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTSF1Q8WW33 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTSF1Q8WW33 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GTSF1Q8WW33 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTSF1Q8WW33 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTSF1Q8WW33 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTSF1Q8WW33 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTSF1Q8WW33 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTSF1Q8WW33 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTSF1Q8WW33 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTSF1Q8WW33 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GTSF1Q8WW33 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTSF1Q8WW33 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GTSF1Q8WW33 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTSF1Q8WW33 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GTSF1Q8WW33 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTSF1Q8WW33 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTSF1Q8WW33 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTSF1Q8WW33 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTSF1Q8WW33 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTSF1Q8WW33 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTSF1Q8WW33 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GTSF1Q8WW33 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTSF1Q8WW33 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GTSF1Q8WW33 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GTSF1Q8WW33 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GTSF1Q8WW33 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTSF1Q8WW33 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTSF1Q8WW33 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GTSF1Q8WW33 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTSF1Q8WW33 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTSF1Q8WW33 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTSF1Q8WW33 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTSF1Q8WW33 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTSF1Q8WW33 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTSF1Q8WW33 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTSF1Q8WW33 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms