Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CARMIL3Q8ND23 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CARMIL3Q8ND23 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CARMIL3Q8ND23 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CARMIL3Q8ND23 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CARMIL3Q8ND23 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CARMIL3Q8ND23 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CARMIL3Q8ND23 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CARMIL3Q8ND23 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CARMIL3Q8ND23 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CARMIL3Q8ND23 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CARMIL3Q8ND23 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CARMIL3Q8ND23 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CARMIL3Q8ND23 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CARMIL3Q8ND23 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CARMIL3Q8ND23 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CARMIL3Q8ND23 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CARMIL3Q8ND23 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CARMIL3Q8ND23 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CARMIL3Q8ND23 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CARMIL3Q8ND23 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CARMIL3Q8ND23 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CARMIL3Q8ND23 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CARMIL3Q8ND23 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CARMIL3Q8ND23 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CARMIL3Q8ND23 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CARMIL3Q8ND23 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CARMIL3Q8ND23 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CARMIL3Q8ND23 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CARMIL3Q8ND23 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CARMIL3Q8ND23 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CARMIL3Q8ND23 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CARMIL3Q8ND23 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CARMIL3Q8ND23 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CARMIL3Q8ND23 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CARMIL3Q8ND23 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CARMIL3Q8ND23 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CARMIL3Q8ND23 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CARMIL3Q8ND23 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CARMIL3Q8ND23 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CARMIL3Q8ND23 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CARMIL3Q8ND23 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CARMIL3Q8ND23 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CARMIL3Q8ND23 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CARMIL3Q8ND23 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CARMIL3Q8ND23 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CARMIL3Q8ND23 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CARMIL3Q8ND23 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CARMIL3Q8ND23 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CARMIL3Q8ND23 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CARMIL3Q8ND23 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CARMIL3Q8ND23 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CARMIL3Q8ND23 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CARMIL3Q8ND23 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CARMIL3Q8ND23 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CARMIL3Q8ND23 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CARMIL3Q8ND23 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CARMIL3Q8ND23 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CARMIL3Q8ND23 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CARMIL3Q8ND23 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CARMIL3Q8ND23 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CARMIL3Q8ND23 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CARMIL3Q8ND23 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CARMIL3Q8ND23 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CARMIL3Q8ND23 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CARMIL3Q8ND23 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CARMIL3Q8ND23 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CARMIL3Q8ND23 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms