Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBD8

TMEM229B, Transmembrane protein 229B, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229BQ8NBD8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM229BQ8NBD8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms