Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYM2

SLFN12, Schlafen family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN12Q8IYM2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLFN12Q8IYM2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLFN12Q8IYM2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms