Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP34Q70CQ2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
USP34Q70CQ2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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