Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TPGS1Q6ZTW0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPGS1Q6ZTW0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms