Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CASC2Q6XLA1 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms