Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY18

LINGO4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO4Q6UY18 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
LINGO4Q6UY18 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINGO4Q6UY18 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINGO4Q6UY18 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINGO4Q6UY18 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINGO4Q6UY18 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINGO4Q6UY18 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINGO4Q6UY18 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINGO4Q6UY18 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINGO4Q6UY18 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms