Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZM2

RRAGB, Ras-related GTP-binding protein B, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRAGBQ5VZM2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRAGBQ5VZM2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRAGBQ5VZM2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRAGBQ5VZM2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRAGBQ5VZM2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRAGBQ5VZM2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRAGBQ5VZM2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRAGBQ5VZM2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRAGBQ5VZM2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRAGBQ5VZM2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRAGBQ5VZM2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRAGBQ5VZM2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRAGBQ5VZM2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRAGBQ5VZM2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRAGBQ5VZM2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRAGBQ5VZM2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRAGBQ5VZM2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRAGBQ5VZM2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RRAGBQ5VZM2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRAGBQ5VZM2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRAGBQ5VZM2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRAGBQ5VZM2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRAGBQ5VZM2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms