Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RIF1Q5UIP0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms