Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1R4

HIVEP3, Transcription factor HIVEP3, humanhuman

Predictions only

Length 2,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP3Q5T1R4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HIVEP3Q5T1R4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms