Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms