Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKDCCQ504Y2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKDCCQ504Y2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKDCCQ504Y2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKDCCQ504Y2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKDCCQ504Y2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKDCCQ504Y2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKDCCQ504Y2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKDCCQ504Y2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKDCCQ504Y2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKDCCQ504Y2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKDCCQ504Y2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKDCCQ504Y2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKDCCQ504Y2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKDCCQ504Y2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKDCCQ504Y2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKDCCQ504Y2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKDCCQ504Y2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKDCCQ504Y2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKDCCQ504Y2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKDCCQ504Y2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKDCCQ504Y2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKDCCQ504Y2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKDCCQ504Y2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKDCCQ504Y2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKDCCQ504Y2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKDCCQ504Y2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PKDCCQ504Y2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKDCCQ504Y2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKDCCQ504Y2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKDCCQ504Y2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKDCCQ504Y2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKDCCQ504Y2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKDCCQ504Y2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKDCCQ504Y2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKDCCQ504Y2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKDCCQ504Y2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKDCCQ504Y2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKDCCQ504Y2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKDCCQ504Y2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PKDCCQ504Y2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKDCCQ504Y2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKDCCQ504Y2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKDCCQ504Y2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKDCCQ504Y2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKDCCQ504Y2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKDCCQ504Y2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKDCCQ504Y2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PKDCCQ504Y2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKDCCQ504Y2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKDCCQ504Y2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PKDCCQ504Y2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKDCCQ504Y2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PKDCCQ504Y2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKDCCQ504Y2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKDCCQ504Y2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKDCCQ504Y2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKDCCQ504Y2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PKDCCQ504Y2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKDCCQ504Y2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms