Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NFIXQ14938 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NFIXQ14938 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NFIXQ14938 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NFIXQ14938 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NFIXQ14938 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NFIXQ14938 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NFIXQ14938 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NFIXQ14938 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NFIXQ14938 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NFIXQ14938 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NFIXQ14938 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NFIXQ14938 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NFIXQ14938 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NFIXQ14938 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFIXQ14938 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFIXQ14938 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFIXQ14938 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFIXQ14938 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFIXQ14938 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFIXQ14938 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFIXQ14938 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFIXQ14938 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFIXQ14938 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFIXQ14938 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NFIXQ14938 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NFIXQ14938 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NFIXQ14938 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NFIXQ14938 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NFIXQ14938 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
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