Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCN5AQ14524 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCN5AQ14524 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCN5AQ14524 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN5AQ14524 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN5AQ14524 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN5AQ14524 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN5AQ14524 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN5AQ14524 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN5AQ14524 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN5AQ14524 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN5AQ14524 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN5AQ14524 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCN5AQ14524 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN5AQ14524 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN5AQ14524 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN5AQ14524 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN5AQ14524 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN5AQ14524 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN5AQ14524 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCN5AQ14524 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
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