Protein–RNA interactions for Protein: Q13349

ITGAD, Integrin alpha-D, humanhuman

Predictions only

Length 1,161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGADQ13349 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGADQ13349 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms