Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CBX3Q13185 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX3Q13185 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
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