Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDH17Q12864 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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