Protein–RNA interactions for Protein: Q06623

HDA3, HDA1 complex subunit 3, yeastyeast

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3Q06623 LTV1YKL143W 1392 nt5.78□□□□□ -1.48
HDA3Q06623 FPK1YNR047W 2682 nt5.78□□□□□ -1.48
HDA3Q06623 TKL1YPR074C 2043 nt5.77□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 VTH1YIL173W 4650 nt5.77□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 VTH2YJL222W 4650 nt5.77□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 YDR109CYDR109C 2148 nt5.77□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 AZR1YGR224W 1842 nt5.77□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 RPL27BYDR471W 411 nt5.77□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 YER046W-AYER046W-A 330 nt5.77□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 YER087C-AYER087C-A 552 nt5.77□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 MTC2YKL098W 1074 nt5.77□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 SEC13YLR208W 894 nt5.77□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 YOL159CYOL159C 516 nt5.77□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 CAT5YOR125C 702 nt5.77□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 PYC1YGL062W 3537 nt5.77□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 NGL2YMR285C 1548 nt5.77□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 PCS60YBR222C 1632 nt5.77□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 HSP82YPL240C 2130 nt5.77□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 SUB2YDL084W 1341 nt5.76□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 HIR1YBL008W 2523 nt5.76□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 AIM7YDR063W 450 nt5.76□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 YET1YKL065C 621 nt5.76□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt5.76□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 STM1YLR150W 822 nt5.76□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 DDP1YOR163W 567 nt5.76□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 LYS21YDL131W 1323 nt5.75□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 TRP5YGL026C 2124 nt5.75□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 RAD28YDR030C 1521 nt5.75□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 CAB3YKL088W 1716 nt5.75□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 TSC13YDL015C 933 nt5.75□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 YDL163WYDL163W 303 nt5.75□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 BNA7YDR428C 786 nt5.75□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 SEC20YDR498C 1152 nt5.75□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 SEN34YAR008W 828 nt5.75□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 SWS2YNL081C 432 nt5.75□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 MSN1YOL116W 1149 nt5.75□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 UBC11YOR339C 471 nt5.75□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 APD1YBR151W 951 nt5.75□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 PES4YFR023W 1836 nt5.75□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 LSG1YGL099W 1923 nt5.75□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 TRM12YML005W 1389 nt5.75□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 ADE12YNL220W 1302 nt5.74□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 ATP1YBL099W 1638 nt5.74□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 JEM1YJL073W 1938 nt5.74□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 SIT4YDL047W 936 nt5.74□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 MDH3YDL078C 1032 nt5.74□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 YDL187CYDL187C 330 nt5.74□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 RPN12YFR052W 825 nt5.74□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 RPL9AYGL147C 576 nt5.74□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 YLR224WYLR224W 1110 nt5.74□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 BER1YLR412W 825 nt5.74□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 YOL131WYOL131W 327 nt5.74□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 SFM1YOR021C 642 nt5.74□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 YRO2YBR054W 1035 nt5.74□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 YPR170CYPR170C 336 nt5.74□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 CTP1YBR291C 900 nt5.74□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 ARG4YHR018C 1392 nt5.74□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 AFR1YDR085C 1863 nt5.74□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 GCD2YGR083C 1956 nt5.74□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 SRP1YNL189W 1629 nt5.74□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 ERG11YHR007C 1593 nt5.73□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 VAB2YEL005C 849 nt5.73□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 TAM41YGR046W 1158 nt5.73□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 PET54YGR222W 882 nt5.73□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 UBI4YLL039C 1146 nt5.73□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 YBL010CYBL010C 843 nt5.73□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 MCM1YMR043W 861 nt5.73□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt5.73□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 YMR173W-AYMR173W-A 1185 nt5.73□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 CMC2YBL059C-A 330 nt5.73□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 GRX7YBR014C 612 nt5.73□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt5.73□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 snR17asnR17a 333 nt5.73□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 NOP2YNL061W 1857 nt5.73□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 PTK2YJR059W 2457 nt5.72□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 SAT4YCR008W 1812 nt5.72□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 YCR007CYCR007C 720 nt5.72□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 RXT3YDL076C 885 nt5.72□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 YER068C-AYER068C-A 432 nt5.72□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 TOS8YGL096W 831 nt5.72□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 RRN9YMR270C 1098 nt5.72□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 MCK1YNL307C 1128 nt5.72□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 YBR124WYBR124W 360 nt5.72□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt5.72□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 ACC1YNR016C 6702 nt5.72□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 SSK1YLR006C 2139 nt5.72□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 YMR046CYMR046C 1323 nt5.72□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 SET5YHR207C 1581 nt5.72□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 YCT1YLL055W 1596 nt5.72□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 YML082WYML082W 1950 nt5.71□□□□□ -1.49
HDA3Q06623 AMA1YGR225W 1782 nt5.71□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 UBP16YPL072W 1500 nt5.71□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 PBP4YDL053C 558 nt5.71□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 YER076CYER076C 909 nt5.71□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 GET1YGL020C 708 nt5.71□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 ECL1YGR146C 636 nt5.71□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 YLR290CYLR290C 834 nt5.71□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 FLD1YLR404W 858 nt5.71□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 RPL19AYBR084C-A 570 nt5.71□□□□□ -1.5
HDA3Q06623 MRPS5YBR251W 924 nt5.71□□□□□ -1.5
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