Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PSME1Q06323 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PSME1Q06323 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
PSME1Q06323 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PSME1Q06323 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PSME1Q06323 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PSME1Q06323 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
PSME1Q06323 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PSME1Q06323 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PSME1Q06323 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PSME1Q06323 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PSME1Q06323 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PSME1Q06323 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PSME1Q06323 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
PSME1Q06323 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PSME1Q06323 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PSME1Q06323 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PSME1Q06323 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PSME1Q06323 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PSME1Q06323 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PSME1Q06323 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PSME1Q06323 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PSME1Q06323 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PSME1Q06323 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PSME1Q06323 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PSME1Q06323 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PSME1Q06323 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PSME1Q06323 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PSME1Q06323 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PSME1Q06323 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PSME1Q06323 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PSME1Q06323 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PSME1Q06323 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PSME1Q06323 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PSME1Q06323 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PSME1Q06323 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PSME1Q06323 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PSME1Q06323 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PSME1Q06323 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PSME1Q06323 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PSME1Q06323 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PSME1Q06323 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
PSME1Q06323 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
PSME1Q06323 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PSME1Q06323 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PSME1Q06323 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PSME1Q06323 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PSME1Q06323 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.33
PSME1Q06323 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
PSME1Q06323 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PSME1Q06323 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PSME1Q06323 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PSME1Q06323 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PSME1Q06323 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PSME1Q06323 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
PSME1Q06323 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PSME1Q06323 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PSME1Q06323 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PSME1Q06323 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PSME1Q06323 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PSME1Q06323 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PSME1Q06323 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PSME1Q06323 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PSME1Q06323 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PSME1Q06323 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PSME1Q06323 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PSME1Q06323 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PSME1Q06323 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PSME1Q06323 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PSME1Q06323 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
PSME1Q06323 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PSME1Q06323 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PSME1Q06323 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PSME1Q06323 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PSME1Q06323 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PSME1Q06323 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PSME1Q06323 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
PSME1Q06323 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PSME1Q06323 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PSME1Q06323 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PSME1Q06323 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PSME1Q06323 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PSME1Q06323 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PSME1Q06323 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PSME1Q06323 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PSME1Q06323 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PSME1Q06323 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PSME1Q06323 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PSME1Q06323 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PSME1Q06323 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PSME1Q06323 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PSME1Q06323 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PSME1Q06323 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
PSME1Q06323 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PSME1Q06323 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PSME1Q06323 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms