Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FANCCQ00597 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FANCCQ00597 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FANCCQ00597 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FANCCQ00597 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FANCCQ00597 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FANCCQ00597 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FANCCQ00597 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FANCCQ00597 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FANCCQ00597 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FANCCQ00597 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms