Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSBP2P81877 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms