Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HBBP68871 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HBBP68871 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HBBP68871 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HBBP68871 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HBBP68871 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HBBP68871 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HBBP68871 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HBBP68871 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HBBP68871 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HBBP68871 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HBBP68871 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HBBP68871 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HBBP68871 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HBBP68871 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HBBP68871 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HBBP68871 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HBBP68871 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HBBP68871 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HBBP68871 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HBBP68871 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HBBP68871 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HBBP68871 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HBBP68871 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HBBP68871 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HBBP68871 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HBBP68871 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HBBP68871 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HBBP68871 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HBBP68871 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HBBP68871 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBBP68871 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBBP68871 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBBP68871 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBBP68871 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBBP68871 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBBP68871 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBBP68871 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBBP68871 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBBP68871 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBBP68871 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBBP68871 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBBP68871 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBBP68871 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBBP68871 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBBP68871 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBBP68871 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBBP68871 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBBP68871 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBBP68871 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBBP68871 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBBP68871 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBBP68871 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBBP68871 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBBP68871 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBBP68871 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBBP68871 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBBP68871 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBBP68871 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBBP68871 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBBP68871 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBBP68871 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBBP68871 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBBP68871 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HBBP68871 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HBBP68871 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HBBP68871 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HBBP68871 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HBBP68871 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HBBP68871 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HBBP68871 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HBBP68871 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HBBP68871 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HBBP68871 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HBBP68871 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HBBP68871 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HBBP68871 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HBBP68871 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HBBP68871 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HBBP68871 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HBBP68871 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HBBP68871 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HBBP68871 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HBBP68871 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HBBP68871 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HBBP68871 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HBBP68871 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HBBP68871 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HBBP68871 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HBBP68871 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HBBP68871 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HBBP68871 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HBBP68871 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HBBP68871 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HBBP68871 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HBBP68871 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HBBP68871 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HBBP68871 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HBBP68871 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HBBP68871 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms