Protein–RNA interactions for Protein: P67812

SEC11A, Signal peptidase complex catalytic subunit SEC11A, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC11AP67812 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC11AP67812 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms