Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP12AP54707 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP12AP54707 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP12AP54707 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP12AP54707 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP12AP54707 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP12AP54707 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP12AP54707 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP12AP54707 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP12AP54707 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP12AP54707 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP12AP54707 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP12AP54707 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP12AP54707 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP12AP54707 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP12AP54707 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP12AP54707 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP12AP54707 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP12AP54707 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP12AP54707 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP12AP54707 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP12AP54707 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP12AP54707 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP12AP54707 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP12AP54707 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP12AP54707 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP12AP54707 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP12AP54707 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP12AP54707 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP12AP54707 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP12AP54707 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP12AP54707 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP12AP54707 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP12AP54707 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP12AP54707 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP12AP54707 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP12AP54707 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP12AP54707 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP12AP54707 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP12AP54707 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP12AP54707 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP12AP54707 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP12AP54707 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP12AP54707 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP12AP54707 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP12AP54707 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP12AP54707 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP12AP54707 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP12AP54707 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP12AP54707 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP12AP54707 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP12AP54707 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP12AP54707 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP12AP54707 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP12AP54707 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP12AP54707 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP12AP54707 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP12AP54707 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP12AP54707 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP12AP54707 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP12AP54707 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP12AP54707 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP12AP54707 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP12AP54707 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP12AP54707 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP12AP54707 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP12AP54707 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP12AP54707 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP12AP54707 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP12AP54707 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP12AP54707 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP12AP54707 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP12AP54707 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP12AP54707 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP12AP54707 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP12AP54707 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP12AP54707 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP12AP54707 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP12AP54707 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP12AP54707 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP12AP54707 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP12AP54707 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP12AP54707 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP12AP54707 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP12AP54707 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP12AP54707 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP12AP54707 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP12AP54707 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP12AP54707 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP12AP54707 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP12AP54707 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP12AP54707 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP12AP54707 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP12AP54707 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP12AP54707 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP12AP54707 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP12AP54707 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP12AP54707 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP12AP54707 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP12AP54707 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms