Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D1P54289 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms