Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ETV1P50549 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ETV1P50549 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ETV1P50549 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ETV1P50549 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ETV1P50549 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ETV1P50549 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ETV1P50549 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ETV1P50549 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ETV1P50549 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ETV1P50549 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ETV1P50549 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ETV1P50549 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ETV1P50549 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ETV1P50549 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ETV1P50549 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ETV1P50549 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ETV1P50549 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ETV1P50549 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ETV1P50549 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ETV1P50549 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ETV1P50549 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ETV1P50549 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ETV1P50549 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ETV1P50549 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ETV1P50549 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ETV1P50549 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ETV1P50549 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ETV1P50549 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ETV1P50549 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ETV1P50549 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ETV1P50549 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ETV1P50549 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ETV1P50549 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ETV1P50549 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ETV1P50549 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ETV1P50549 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ETV1P50549 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ETV1P50549 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ETV1P50549 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ETV1P50549 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ETV1P50549 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ETV1P50549 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ETV1P50549 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ETV1P50549 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ETV1P50549 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ETV1P50549 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ETV1P50549 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ETV1P50549 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ETV1P50549 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ETV1P50549 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ETV1P50549 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ETV1P50549 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ETV1P50549 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ETV1P50549 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ETV1P50549 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ETV1P50549 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ETV1P50549 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ETV1P50549 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ETV1P50549 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ETV1P50549 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ETV1P50549 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ETV1P50549 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ETV1P50549 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ETV1P50549 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ETV1P50549 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ETV1P50549 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ETV1P50549 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ETV1P50549 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ETV1P50549 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ETV1P50549 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ETV1P50549 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ETV1P50549 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ETV1P50549 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ETV1P50549 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ETV1P50549 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ETV1P50549 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ETV1P50549 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ETV1P50549 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ETV1P50549 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ETV1P50549 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ETV1P50549 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ETV1P50549 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ETV1P50549 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ETV1P50549 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ETV1P50549 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ETV1P50549 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ETV1P50549 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ETV1P50549 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ETV1P50549 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ETV1P50549 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ETV1P50549 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ETV1P50549 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ETV1P50549 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ETV1P50549 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ETV1P50549 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ETV1P50549 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ETV1P50549 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ETV1P50549 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ETV1P50549 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms