Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL35P42766 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL35P42766 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPL35P42766 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPL35P42766 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPL35P42766 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPL35P42766 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPL35P42766 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPL35P42766 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPL35P42766 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPL35P42766 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPL35P42766 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPL35P42766 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPL35P42766 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPL35P42766 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL35P42766 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL35P42766 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL35P42766 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL35P42766 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL35P42766 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL35P42766 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL35P42766 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL35P42766 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL35P42766 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL35P42766 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL35P42766 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL35P42766 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL35P42766 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL35P42766 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL35P42766 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL35P42766 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL35P42766 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL35P42766 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL35P42766 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL35P42766 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL35P42766 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL35P42766 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL35P42766 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL35P42766 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL35P42766 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL35P42766 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL35P42766 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL35P42766 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL35P42766 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL35P42766 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL35P42766 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL35P42766 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL35P42766 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL35P42766 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL35P42766 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL35P42766 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL35P42766 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL35P42766 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL35P42766 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL35P42766 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL35P42766 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL35P42766 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL35P42766 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL35P42766 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL35P42766 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL35P42766 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL35P42766 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL35P42766 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL35P42766 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL35P42766 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL35P42766 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL35P42766 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL35P42766 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL35P42766 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL35P42766 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL35P42766 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL35P42766 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL35P42766 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL35P42766 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL35P42766 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL35P42766 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL35P42766 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL35P42766 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL35P42766 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL35P42766 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL35P42766 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL35P42766 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL35P42766 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL35P42766 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL35P42766 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL35P42766 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL35P42766 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL35P42766 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL35P42766 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL35P42766 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL35P42766 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL35P42766 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL35P42766 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL35P42766 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL35P42766 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL35P42766 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL35P42766 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL35P42766 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL35P42766 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL35P42766 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms