Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPARGP37231 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPARGP37231 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPARGP37231 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPARGP37231 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPARGP37231 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPARGP37231 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPARGP37231 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPARGP37231 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPARGP37231 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPARGP37231 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPARGP37231 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPARGP37231 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPARGP37231 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPARGP37231 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPARGP37231 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPARGP37231 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPARGP37231 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPARGP37231 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPARGP37231 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPARGP37231 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPARGP37231 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPARGP37231 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPARGP37231 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPARGP37231 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPARGP37231 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPARGP37231 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPARGP37231 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPARGP37231 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPARGP37231 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPARGP37231 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPARGP37231 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPARGP37231 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPARGP37231 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPARGP37231 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPARGP37231 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPARGP37231 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPARGP37231 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPARGP37231 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPARGP37231 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPARGP37231 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPARGP37231 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPARGP37231 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPARGP37231 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PPARGP37231 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPARGP37231 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPARGP37231 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPARGP37231 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPARGP37231 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPARGP37231 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPARGP37231 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPARGP37231 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPARGP37231 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPARGP37231 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPARGP37231 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPARGP37231 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PPARGP37231 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPARGP37231 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPARGP37231 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPARGP37231 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPARGP37231 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPARGP37231 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPARGP37231 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPARGP37231 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPARGP37231 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPARGP37231 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPARGP37231 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPARGP37231 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPARGP37231 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPARGP37231 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPARGP37231 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPARGP37231 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPARGP37231 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPARGP37231 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPARGP37231 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPARGP37231 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPARGP37231 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPARGP37231 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPARGP37231 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPARGP37231 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPARGP37231 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPARGP37231 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPARGP37231 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPARGP37231 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PPARGP37231 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PPARGP37231 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PPARGP37231 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PPARGP37231 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PPARGP37231 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPARGP37231 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPARGP37231 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PPARGP37231 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PPARGP37231 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPARGP37231 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPARGP37231 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPARGP37231 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPARGP37231 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPARGP37231 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PPARGP37231 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PPARGP37231 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms