Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms