Protein–RNA interactions for Protein: P30281

CCND3, G1/S-specific cyclin-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND3P30281 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCND3P30281 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCND3P30281 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCND3P30281 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCND3P30281 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCND3P30281 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCND3P30281 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCND3P30281 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCND3P30281 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCND3P30281 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCND3P30281 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCND3P30281 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCND3P30281 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCND3P30281 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCND3P30281 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCND3P30281 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCND3P30281 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCND3P30281 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCND3P30281 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCND3P30281 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCND3P30281 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCND3P30281 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCND3P30281 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCND3P30281 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCND3P30281 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCND3P30281 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCND3P30281 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCND3P30281 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCND3P30281 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCND3P30281 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCND3P30281 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCND3P30281 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCND3P30281 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCND3P30281 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCND3P30281 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCND3P30281 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCND3P30281 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCND3P30281 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCND3P30281 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCND3P30281 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCND3P30281 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCND3P30281 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCND3P30281 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCND3P30281 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCND3P30281 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCND3P30281 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCND3P30281 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCND3P30281 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCND3P30281 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCND3P30281 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCND3P30281 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCND3P30281 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCND3P30281 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCND3P30281 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCND3P30281 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCND3P30281 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCND3P30281 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCND3P30281 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCND3P30281 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCND3P30281 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCND3P30281 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCND3P30281 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCND3P30281 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCND3P30281 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCND3P30281 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCND3P30281 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCND3P30281 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCND3P30281 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCND3P30281 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCND3P30281 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCND3P30281 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCND3P30281 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCND3P30281 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCND3P30281 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCND3P30281 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCND3P30281 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCND3P30281 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCND3P30281 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCND3P30281 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCND3P30281 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCND3P30281 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCND3P30281 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCND3P30281 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCND3P30281 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCND3P30281 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCND3P30281 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCND3P30281 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCND3P30281 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCND3P30281 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCND3P30281 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCND3P30281 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCND3P30281 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCND3P30281 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCND3P30281 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCND3P30281 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCND3P30281 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCND3P30281 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCND3P30281 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCND3P30281 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCND3P30281 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms