Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP5DP30049 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP5DP30049 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP5DP30049 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP5DP30049 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP5DP30049 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP5DP30049 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP5DP30049 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP5DP30049 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP5DP30049 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP5DP30049 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP5DP30049 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP5DP30049 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP5DP30049 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP5DP30049 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP5DP30049 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP5DP30049 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP5DP30049 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP5DP30049 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP5DP30049 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP5DP30049 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP5DP30049 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP5DP30049 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP5DP30049 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP5DP30049 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP5DP30049 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP5DP30049 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP5DP30049 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP5DP30049 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP5DP30049 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP5DP30049 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP5DP30049 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP5DP30049 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP5DP30049 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP5DP30049 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP5DP30049 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP5DP30049 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms