Protein–RNA interactions for Protein: P27824

CANX, Calnexin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CANXP27824 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CANXP27824 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CANXP27824 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CANXP27824 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CANXP27824 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CANXP27824 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CANXP27824 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CANXP27824 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CANXP27824 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CANXP27824 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CANXP27824 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CANXP27824 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CANXP27824 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CANXP27824 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CANXP27824 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CANXP27824 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CANXP27824 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CANXP27824 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CANXP27824 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CANXP27824 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CANXP27824 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CANXP27824 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CANXP27824 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CANXP27824 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CANXP27824 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CANXP27824 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CANXP27824 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CANXP27824 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CANXP27824 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CANXP27824 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CANXP27824 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CANXP27824 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CANXP27824 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CANXP27824 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CANXP27824 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CANXP27824 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CANXP27824 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CANXP27824 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CANXP27824 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CANXP27824 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CANXP27824 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CANXP27824 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CANXP27824 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CANXP27824 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CANXP27824 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CANXP27824 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CANXP27824 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CANXP27824 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CANXP27824 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CANXP27824 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CANXP27824 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CANXP27824 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CANXP27824 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CANXP27824 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CANXP27824 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CANXP27824 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CANXP27824 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CANXP27824 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CANXP27824 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CANXP27824 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CANXP27824 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CANXP27824 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CANXP27824 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CANXP27824 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CANXP27824 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CANXP27824 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CANXP27824 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CANXP27824 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CANXP27824 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CANXP27824 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CANXP27824 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CANXP27824 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CANXP27824 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CANXP27824 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CANXP27824 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CANXP27824 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CANXP27824 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CANXP27824 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CANXP27824 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CANXP27824 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CANXP27824 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CANXP27824 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CANXP27824 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CANXP27824 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CANXP27824 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CANXP27824 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CANXP27824 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CANXP27824 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CANXP27824 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CANXP27824 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CANXP27824 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CANXP27824 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CANXP27824 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CANXP27824 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CANXP27824 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CANXP27824 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CANXP27824 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CANXP27824 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CANXP27824 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CANXP27824 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms