Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE4AP27815 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE4AP27815 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms