Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DESP17661 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DESP17661 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DESP17661 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DESP17661 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DESP17661 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DESP17661 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DESP17661 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DESP17661 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DESP17661 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DESP17661 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DESP17661 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DESP17661 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DESP17661 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DESP17661 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DESP17661 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DESP17661 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DESP17661 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DESP17661 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DESP17661 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DESP17661 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DESP17661 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DESP17661 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DESP17661 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DESP17661 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DESP17661 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DESP17661 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DESP17661 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DESP17661 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DESP17661 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DESP17661 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DESP17661 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DESP17661 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DESP17661 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DESP17661 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DESP17661 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DESP17661 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DESP17661 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DESP17661 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DESP17661 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DESP17661 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DESP17661 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DESP17661 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DESP17661 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DESP17661 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DESP17661 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DESP17661 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DESP17661 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DESP17661 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DESP17661 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DESP17661 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DESP17661 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DESP17661 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DESP17661 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DESP17661 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DESP17661 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DESP17661 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DESP17661 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DESP17661 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DESP17661 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DESP17661 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DESP17661 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DESP17661 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DESP17661 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DESP17661 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DESP17661 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DESP17661 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DESP17661 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DESP17661 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DESP17661 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DESP17661 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DESP17661 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DESP17661 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DESP17661 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DESP17661 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DESP17661 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DESP17661 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DESP17661 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DESP17661 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DESP17661 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DESP17661 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DESP17661 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DESP17661 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DESP17661 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DESP17661 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DESP17661 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DESP17661 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DESP17661 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DESP17661 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DESP17661 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DESP17661 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DESP17661 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DESP17661 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DESP17661 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DESP17661 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DESP17661 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DESP17661 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DESP17661 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DESP17661 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DESP17661 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms