Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GCFC2P16383 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCFC2P16383 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms