Protein–RNA interactions for Protein: P15884

TCF4, Transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF4P15884 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCF4P15884 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCF4P15884 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCF4P15884 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCF4P15884 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCF4P15884 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCF4P15884 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCF4P15884 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCF4P15884 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCF4P15884 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCF4P15884 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCF4P15884 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCF4P15884 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCF4P15884 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCF4P15884 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCF4P15884 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCF4P15884 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCF4P15884 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCF4P15884 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCF4P15884 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCF4P15884 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TCF4P15884 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TCF4P15884 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TCF4P15884 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF4P15884 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF4P15884 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF4P15884 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF4P15884 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF4P15884 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF4P15884 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF4P15884 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF4P15884 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF4P15884 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF4P15884 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF4P15884 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF4P15884 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF4P15884 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF4P15884 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF4P15884 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF4P15884 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF4P15884 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF4P15884 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF4P15884 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF4P15884 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF4P15884 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF4P15884 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF4P15884 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF4P15884 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF4P15884 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCF4P15884 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCF4P15884 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCF4P15884 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCF4P15884 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCF4P15884 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCF4P15884 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCF4P15884 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCF4P15884 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TCF4P15884 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCF4P15884 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCF4P15884 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TCF4P15884 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCF4P15884 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCF4P15884 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCF4P15884 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCF4P15884 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCF4P15884 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCF4P15884 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCF4P15884 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCF4P15884 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCF4P15884 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCF4P15884 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCF4P15884 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TCF4P15884 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCF4P15884 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCF4P15884 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TCF4P15884 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCF4P15884 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCF4P15884 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF4P15884 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF4P15884 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF4P15884 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF4P15884 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF4P15884 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF4P15884 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF4P15884 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF4P15884 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF4P15884 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF4P15884 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF4P15884 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF4P15884 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF4P15884 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCF4P15884 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCF4P15884 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCF4P15884 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCF4P15884 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCF4P15884 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCF4P15884 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCF4P15884 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCF4P15884 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCF4P15884 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms