Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 AL390728.6-201ENST00000566446 1246 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXB1P14653 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXB1P14653 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXB1P14653 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXB1P14653 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXB1P14653 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXB1P14653 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms