Protein–RNA interactions for Protein: P0DJ93

SMIM13, Small integral membrane protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM13P0DJ93 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms