Protein–RNA interactions for Protein: P0C866

LINC00869, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00869, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00869P0C866 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00869P0C866 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LINC00869P0C866 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LINC00869P0C866 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LINC00869P0C866 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LINC00869P0C866 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00869P0C866 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00869P0C866 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00869P0C866 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00869P0C866 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00869P0C866 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00869P0C866 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00869P0C866 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00869P0C866 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00869P0C866 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00869P0C866 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00869P0C866 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00869P0C866 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00869P0C866 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00869P0C866 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00869P0C866 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00869P0C866 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00869P0C866 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00869P0C866 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00869P0C866 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00869P0C866 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00869P0C866 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00869P0C866 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00869P0C866 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms