Protein–RNA interactions for Protein: P09326

CD48, CD48 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD48P09326 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD48P09326 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CD48P09326 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD48P09326 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD48P09326 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD48P09326 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD48P09326 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD48P09326 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD48P09326 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD48P09326 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD48P09326 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD48P09326 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD48P09326 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD48P09326 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD48P09326 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD48P09326 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CD48P09326 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD48P09326 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD48P09326 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD48P09326 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD48P09326 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD48P09326 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD48P09326 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD48P09326 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD48P09326 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD48P09326 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD48P09326 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD48P09326 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CD48P09326 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD48P09326 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD48P09326 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD48P09326 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD48P09326 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD48P09326 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD48P09326 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD48P09326 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD48P09326 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD48P09326 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD48P09326 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CD48P09326 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD48P09326 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD48P09326 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD48P09326 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD48P09326 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD48P09326 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD48P09326 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD48P09326 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD48P09326 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD48P09326 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD48P09326 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD48P09326 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD48P09326 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD48P09326 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD48P09326 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD48P09326 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CD48P09326 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD48P09326 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD48P09326 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD48P09326 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD48P09326 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CD48P09326 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD48P09326 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD48P09326 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD48P09326 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD48P09326 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD48P09326 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD48P09326 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD48P09326 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD48P09326 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CD48P09326 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD48P09326 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD48P09326 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD48P09326 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD48P09326 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD48P09326 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD48P09326 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD48P09326 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD48P09326 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD48P09326 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CD48P09326 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD48P09326 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD48P09326 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD48P09326 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD48P09326 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD48P09326 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD48P09326 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD48P09326 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD48P09326 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD48P09326 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD48P09326 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CD48P09326 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD48P09326 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD48P09326 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CD48P09326 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD48P09326 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD48P09326 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD48P09326 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD48P09326 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD48P09326 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD48P09326 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms