Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ACAA1P09110 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACAA1P09110 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACAA1P09110 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACAA1P09110 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACAA1P09110 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms