Protein–RNA interactions for Protein: P06858

LPL, Lipoprotein lipase, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPLP06858 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LPLP06858 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LPLP06858 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LPLP06858 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LPLP06858 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LPLP06858 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LPLP06858 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LPLP06858 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LPLP06858 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
LPLP06858 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LPLP06858 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LPLP06858 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LPLP06858 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LPLP06858 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LPLP06858 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LPLP06858 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LPLP06858 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LPLP06858 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LPLP06858 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LPLP06858 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LPLP06858 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LPLP06858 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LPLP06858 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LPLP06858 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LPLP06858 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LPLP06858 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LPLP06858 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LPLP06858 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LPLP06858 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LPLP06858 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LPLP06858 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LPLP06858 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LPLP06858 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LPLP06858 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LPLP06858 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LPLP06858 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LPLP06858 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LPLP06858 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LPLP06858 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LPLP06858 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LPLP06858 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LPLP06858 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LPLP06858 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LPLP06858 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LPLP06858 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LPLP06858 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LPLP06858 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LPLP06858 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LPLP06858 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LPLP06858 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LPLP06858 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LPLP06858 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LPLP06858 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LPLP06858 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LPLP06858 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LPLP06858 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LPLP06858 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LPLP06858 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LPLP06858 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LPLP06858 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LPLP06858 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LPLP06858 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LPLP06858 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LPLP06858 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LPLP06858 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LPLP06858 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LPLP06858 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LPLP06858 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LPLP06858 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LPLP06858 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LPLP06858 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LPLP06858 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LPLP06858 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LPLP06858 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LPLP06858 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LPLP06858 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LPLP06858 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LPLP06858 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LPLP06858 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LPLP06858 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LPLP06858 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LPLP06858 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LPLP06858 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LPLP06858 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LPLP06858 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LPLP06858 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LPLP06858 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LPLP06858 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LPLP06858 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LPLP06858 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LPLP06858 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LPLP06858 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LPLP06858 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LPLP06858 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LPLP06858 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LPLP06858 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LPLP06858 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LPLP06858 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LPLP06858 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LPLP06858 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms