Protein–RNA interactions for Protein: P05230

FGF1, Fibroblast growth factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF1P05230 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FGF1P05230 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FGF1P05230 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FGF1P05230 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FGF1P05230 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FGF1P05230 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FGF1P05230 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FGF1P05230 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FGF1P05230 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FGF1P05230 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FGF1P05230 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FGF1P05230 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FGF1P05230 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FGF1P05230 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGF1P05230 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGF1P05230 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGF1P05230 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGF1P05230 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGF1P05230 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGF1P05230 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGF1P05230 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGF1P05230 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGF1P05230 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGF1P05230 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGF1P05230 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGF1P05230 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGF1P05230 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGF1P05230 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGF1P05230 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGF1P05230 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGF1P05230 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FGF1P05230 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGF1P05230 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGF1P05230 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGF1P05230 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGF1P05230 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGF1P05230 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGF1P05230 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGF1P05230 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGF1P05230 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGF1P05230 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGF1P05230 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGF1P05230 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGF1P05230 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGF1P05230 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FGF1P05230 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGF1P05230 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGF1P05230 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGF1P05230 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGF1P05230 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGF1P05230 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FGF1P05230 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGF1P05230 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGF1P05230 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FGF1P05230 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FGF1P05230 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FGF1P05230 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FGF1P05230 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FGF1P05230 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FGF1P05230 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FGF1P05230 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FGF1P05230 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FGF1P05230 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FGF1P05230 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FGF1P05230 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FGF1P05230 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FGF1P05230 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGF1P05230 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGF1P05230 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGF1P05230 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGF1P05230 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGF1P05230 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGF1P05230 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGF1P05230 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGF1P05230 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGF1P05230 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGF1P05230 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGF1P05230 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGF1P05230 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGF1P05230 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGF1P05230 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGF1P05230 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGF1P05230 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGF1P05230 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGF1P05230 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGF1P05230 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGF1P05230 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGF1P05230 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGF1P05230 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGF1P05230 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGF1P05230 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGF1P05230 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGF1P05230 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGF1P05230 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGF1P05230 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGF1P05230 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGF1P05230 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGF1P05230 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGF1P05230 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FGF1P05230 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms