Protein–RNA interactions for Protein: P04818

TYMS, Thymidylate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMSP04818 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TYMSP04818 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TYMSP04818 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TYMSP04818 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TYMSP04818 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TYMSP04818 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TYMSP04818 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TYMSP04818 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TYMSP04818 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TYMSP04818 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TYMSP04818 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TYMSP04818 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TYMSP04818 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TYMSP04818 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TYMSP04818 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TYMSP04818 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TYMSP04818 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TYMSP04818 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TYMSP04818 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TYMSP04818 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TYMSP04818 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TYMSP04818 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TYMSP04818 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TYMSP04818 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TYMSP04818 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TYMSP04818 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TYMSP04818 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TYMSP04818 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TYMSP04818 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TYMSP04818 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TYMSP04818 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TYMSP04818 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TYMSP04818 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TYMSP04818 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TYMSP04818 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TYMSP04818 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TYMSP04818 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TYMSP04818 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TYMSP04818 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TYMSP04818 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TYMSP04818 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TYMSP04818 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TYMSP04818 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TYMSP04818 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TYMSP04818 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TYMSP04818 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TYMSP04818 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TYMSP04818 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TYMSP04818 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TYMSP04818 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TYMSP04818 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TYMSP04818 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TYMSP04818 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TYMSP04818 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TYMSP04818 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TYMSP04818 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TYMSP04818 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TYMSP04818 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TYMSP04818 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TYMSP04818 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TYMSP04818 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TYMSP04818 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TYMSP04818 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TYMSP04818 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TYMSP04818 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TYMSP04818 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TYMSP04818 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TYMSP04818 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TYMSP04818 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TYMSP04818 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TYMSP04818 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TYMSP04818 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TYMSP04818 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TYMSP04818 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TYMSP04818 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TYMSP04818 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TYMSP04818 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TYMSP04818 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TYMSP04818 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TYMSP04818 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TYMSP04818 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TYMSP04818 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TYMSP04818 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TYMSP04818 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TYMSP04818 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TYMSP04818 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TYMSP04818 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TYMSP04818 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TYMSP04818 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TYMSP04818 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TYMSP04818 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TYMSP04818 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TYMSP04818 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TYMSP04818 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TYMSP04818 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TYMSP04818 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TYMSP04818 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TYMSP04818 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TYMSP04818 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TYMSP04818 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms