Protein–RNA interactions for Protein: O95343

SIX3, Homeobox protein SIX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3O95343 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIX3O95343 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIX3O95343 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIX3O95343 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIX3O95343 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIX3O95343 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIX3O95343 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIX3O95343 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIX3O95343 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIX3O95343 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIX3O95343 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIX3O95343 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIX3O95343 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SIX3O95343 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIX3O95343 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SIX3O95343 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIX3O95343 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIX3O95343 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIX3O95343 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIX3O95343 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIX3O95343 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIX3O95343 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIX3O95343 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIX3O95343 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIX3O95343 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIX3O95343 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIX3O95343 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIX3O95343 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIX3O95343 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIX3O95343 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIX3O95343 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIX3O95343 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIX3O95343 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIX3O95343 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIX3O95343 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SIX3O95343 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIX3O95343 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIX3O95343 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIX3O95343 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIX3O95343 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIX3O95343 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIX3O95343 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIX3O95343 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIX3O95343 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIX3O95343 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIX3O95343 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIX3O95343 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIX3O95343 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIX3O95343 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIX3O95343 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIX3O95343 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SIX3O95343 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SIX3O95343 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIX3O95343 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIX3O95343 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIX3O95343 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIX3O95343 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIX3O95343 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIX3O95343 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIX3O95343 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIX3O95343 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIX3O95343 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIX3O95343 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIX3O95343 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIX3O95343 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIX3O95343 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIX3O95343 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIX3O95343 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIX3O95343 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIX3O95343 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIX3O95343 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SIX3O95343 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIX3O95343 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIX3O95343 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIX3O95343 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIX3O95343 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIX3O95343 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIX3O95343 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIX3O95343 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIX3O95343 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIX3O95343 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIX3O95343 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIX3O95343 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIX3O95343 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIX3O95343 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SIX3O95343 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIX3O95343 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SIX3O95343 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SIX3O95343 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SIX3O95343 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SIX3O95343 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SIX3O95343 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIX3O95343 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIX3O95343 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIX3O95343 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIX3O95343 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SIX3O95343 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIX3O95343 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIX3O95343 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIX3O95343 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms