Protein–RNA interactions for Protein: O95260

ATE1, Arginyl-tRNA--protein transferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1O95260 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATE1O95260 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATE1O95260 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATE1O95260 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATE1O95260 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATE1O95260 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATE1O95260 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATE1O95260 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATE1O95260 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATE1O95260 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATE1O95260 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATE1O95260 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATE1O95260 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATE1O95260 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATE1O95260 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATE1O95260 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATE1O95260 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATE1O95260 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATE1O95260 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATE1O95260 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATE1O95260 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATE1O95260 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATE1O95260 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATE1O95260 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATE1O95260 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATE1O95260 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATE1O95260 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATE1O95260 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATE1O95260 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATE1O95260 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATE1O95260 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATE1O95260 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATE1O95260 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATE1O95260 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATE1O95260 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATE1O95260 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATE1O95260 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATE1O95260 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATE1O95260 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATE1O95260 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATE1O95260 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATE1O95260 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATE1O95260 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATE1O95260 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATE1O95260 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATE1O95260 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATE1O95260 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATE1O95260 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATE1O95260 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATE1O95260 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATE1O95260 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATE1O95260 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATE1O95260 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATE1O95260 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATE1O95260 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATE1O95260 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATE1O95260 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATE1O95260 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATE1O95260 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATE1O95260 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATE1O95260 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATE1O95260 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATE1O95260 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATE1O95260 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATE1O95260 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATE1O95260 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ATE1O95260 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATE1O95260 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ATE1O95260 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATE1O95260 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATE1O95260 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATE1O95260 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATE1O95260 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATE1O95260 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATE1O95260 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATE1O95260 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATE1O95260 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATE1O95260 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATE1O95260 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATE1O95260 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATE1O95260 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATE1O95260 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATE1O95260 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATE1O95260 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATE1O95260 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATE1O95260 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATE1O95260 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATE1O95260 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATE1O95260 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATE1O95260 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATE1O95260 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATE1O95260 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATE1O95260 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATE1O95260 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATE1O95260 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATE1O95260 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATE1O95260 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATE1O95260 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ATE1O95260 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATE1O95260 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms