Protein–RNA interactions for Protein: O94979

SEC31A, Protein transport protein Sec31A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31AO94979 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC31AO94979 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC31AO94979 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC31AO94979 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC31AO94979 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC31AO94979 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC31AO94979 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC31AO94979 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC31AO94979 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC31AO94979 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC31AO94979 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC31AO94979 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC31AO94979 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC31AO94979 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC31AO94979 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC31AO94979 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC31AO94979 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC31AO94979 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC31AO94979 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC31AO94979 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC31AO94979 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC31AO94979 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC31AO94979 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC31AO94979 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC31AO94979 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC31AO94979 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC31AO94979 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC31AO94979 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC31AO94979 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC31AO94979 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC31AO94979 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC31AO94979 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC31AO94979 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC31AO94979 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC31AO94979 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC31AO94979 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC31AO94979 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC31AO94979 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC31AO94979 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC31AO94979 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC31AO94979 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC31AO94979 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC31AO94979 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC31AO94979 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC31AO94979 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC31AO94979 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC31AO94979 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC31AO94979 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms